・基本レベル順に記載しているが一部ストーリーの流れ的に前後して記載。
・逢魔が時ミッションは推奨レベルより道中の難易度が高い傾向があり、かつランダム配信なので順番にこだわる必要はまったくない。
・修行ミッションは中伝以降、武器熟練度や「忍」「呪」の能力値も関係するので状況に合わせてプレイすると良い。
| ミッション名 | Lv | ミッション種別 | 発生条件 | 備考 |
|---|---|---|---|---|
| 伊賀越え | 70 | メインミッション | 比叡山の魔達成後、東海篇へ進む | 東海篇を開始すると伊賀越え（Lv.70）と三つの魂（Lv.65）が発生しているが、東海篇の開始ムービーでの流れ的には伊賀越えが先かと思われる。 |
| 武の道・奧伝 | 65 | 修行ミッション | 武の道・中伝、伊賀越え達成 / 必要な最高武器熟練度 300000 | |
| 忍の道・奧伝 | 65 | 修行ミッション | 忍の道・中伝、伊賀越え達成 / 必要な「忍」15 | |
| 陰陽の道・奧伝 | 65 | 修行ミッション | 陰陽の道・中伝、伊賀越え達成 / 必要な「呪」15 | |
| 三つの魂 | 65 | サブミッション | 比叡山の魔達成後、東海篇へ進む | |
| 枯尾花とあやかし | 71 | サブミッション | 伊賀越え達成 | |
| より強き火を求めて | 73 | サブミッション | 伊賀越え達成 | |
| 彼岸への想い | 78 | メインミッション | 伊賀越え達成 | |
| 名匠の行方 | 79 | サブミッション | 彼岸への想い達成 | |
| 七つの福音 | 80 | サブミッション | 彼岸への想い達成 | |
| 背負いし者 | 0 | メインミッション | 彼岸への想い達成 | ミッション終了後、穢土の城（Lv.87）と桶狭間の怪（Lv.84）が発生しているが、お勝が捕らえられているシーンがあるので流れ的には穢土の城（Lv.87）が先 「サムライの道」でのみ1度だけ発生する（周回しても二度と発生しない）イベントミッション |
| 穢土の城 | 87 | メインミッション | 背負いし者達成 | 「強者の道」以降は彼岸への想い達成で発生する |
| 桶狭間の怪 | 84 | サブミッション | 背負いし者達成 | 「強者の道」以降は彼岸への想い達成で発生する |
| 忍び寄る影 | 88 | サブミッション | 穢土の城達成 | |
| 血濡れの地獄花 | 90 | 逢魔が時ミッション | 彼岸への想い達成 | |
| 大蝦蟇大立回り | 91 | サブミッション | 穢土の城達成 | |
| 東国無双 | 93 | サブミッション | 忍び寄る影達成 | |
| 逢魔が辻 | 100 | 逢魔が時ミッション | 穢土の城達成 | |
| 剣聖の高弟 | 145 | サブミッション | 奥義習得:剣禅一如 奥義習得:無双十文字 近江篇:魔王耀変 上記3つのミッションを達成 | Ver.1.06(2017/3/24配信)で追加された高レベルサブミッション |
| 転（まろばし） | 155 | サブミッション | 剣聖の高弟達成 | Ver.1.06(2017/3/24配信)で追加された高レベルサブミッション |
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